En un estudio reciente publicado en enfermedades infecciosas emergentesEn este estudio, los investigadores realizaron una evaluación comparativa de las características epidemiológicas clave, como las tasas de ataque secundario (SAR), la transmisión, el intervalo de serie y el período de incubación de la infección por SARS-CoV-2 mediante las variables Omicron y Delta.

Según datos de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC), en diciembre de 2021 se identificaron 622 casos indicadores, 455 casos secundarios de infección por Omicron y 1.420 contactos estrechos mediante rastreo de contactos en la región de Cantabria, España.

sobre estudiar

En este estudio, los investigadores informan de características epidemiológicas clave como SAR, transmisibilidad, intervalo de secuencia y período de incubación de la infección por Omicron en España. También compararon estas características con las de la infección delta.

Un total de 63 muestras obtenidas de una infección por Omicron diagnosticada mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR) en tiempo real se sometieron a un análisis de genotipado de un solo nucleótido (SNP) que se centró en las mutaciones L452R y K417N. Las muestras negativas para L4523 y positivas para K417N se consideraron infección por omicrones y se seleccionaron para análisis adicionales.

El análisis fue validado por secuenciación del genoma completo. Se prepararon bibliotecas genómicas y posteriormente se secuenciaron. Los datos de próxima generación se recopilaron y analizaron más, y los linajes se mapearon utilizando el programa filogenético global Pangolin.

Se obtuvieron datos del programa de rastreo de contactos de Cantabria sobre características sociodemográficas como estado de vacunación (no vacunado/totalmente vacunado), edad, ausencia o presencia de síntomas, fecha de inicio de síntomas (SOD) y fecha de diagnóstico (DD) para infecciones sintomáticas y asintomáticas. , respectivamente. . También se obtuvieron los datos correspondientes para 1299 infecciones delta (de 1708 infecciones por SARS-CoV-2) en noviembre de 2021.

Los contactos cercanos (individuos dentro de los dos metros de un paciente en estado índice durante >15 min) se identificaron 2 días antes y 10 días después de la SOD en estado índice y se clasificaron como sociales, domésticos y ocupacionales según el estado de transmisión del SARS-CoV-2 .

La SAR global se definió como el promedio de casos secundarios en estrecho contacto. Diferencias de SAR variables y basadas en entornos de contacto entre infecciones omicron y delta de pacientes no vacunados y vacunados con Pearson X.² Analítica. Se calculó la media, media, rango intercuartílico (RIC), media del periodo de transmisión, periodo de incubación y periodos seriados para ambas variables.

Solo se consideraron los casos índice sintomáticos para determinar el período de incubación, los períodos de serie y los períodos de transmisión. El período de transmisión se definió como el período entre el estado de SOD y la fecha del último contacto con contactos secundarios que estaban infectados.

Solo se consideraron los casos de síntomas secundarios para determinar la serie y los períodos de incubación. El período de incubación se definió como el período entre la fecha del último contacto y la fecha del caso secundario SOD. El intervalo serial se definió como el período entre el estado indicador SOD y el estado secundario SOD.

Consecuencias

Se identificaron un total de 12.587 y 2201 contactos cercanos y casos secundarios, respectivamente, de los cuales 356 y 1642 casos secundarios fueron por las variantes Omicron y Delta, respectivamente.

Las tasas globales de SAR para los casos de Omicron y Delta fueron del 39 % y el 26 %, respectivamente. Esto indica un aumento absoluto de 13 puntos (9,9 a 16,1) en el SAR por la variable Omicron. El SAR fue mayor en los entornos sociales omicron que en las variantes delta (30,5 % frente a 16,2 %) y entornos laborales (31 % frente a 10,5 %), pero no en entornos domésticos (49,4 % frente a 48 %).

Entre las infecciones delta, en general, las SAR fueron significativamente más altas para los pacientes no vacunados (7,8 %) que para los pacientes vacunados. Las tasas de SAR para entornos domésticos y profesionales fueron del 9,9 % y el 9,5 %, respectivamente. Sin embargo, para la infección por Omicron, no se observaron diferencias significativas entre pacientes vacunados y no vacunados en ninguno de los entornos de contacto.

El período de transmisión medio y mediano fue más corto para la variante Omicron que para la variante Delta. 0,5 frente a 0,8 y día cero frente a día 1, respectivamente. La diferencia de medias entre las dos variables fue significativa (-0,3 días), mientras que el CI fue igual. Esto indica que omicron tiene una mayor transmisibilidad que delta.

La mediana del período de incubación fue de tres días para las variables omicron y delta sin diferencias significativas. Sin embargo, Omicron tuvo un IQR corto. El período serial mediano para la infección por omicron fue significativamente más corto que para la infección delta (4,8 días frente a 5,4 días). Los valores medios correspondientes fueron cuatro y cinco días, respectivamente. Sin embargo, no hubo diferencias significativas entre los pacientes vacunados y no vacunados en cuanto a la transmisión, la incubación o los períodos de intervalo en serie.

Conclusión

Los resultados del estudio muestran que Omicron es más transmisible que Delta en entornos sociales y laborales con una tasa de SAR global significativamente más alta (~50 %) y un intervalo de secuencia significativamente más bajo (IQR 3 frente a 5) en España. Además, la vacunación confirió cierta protección contra la infección secundaria por SARS. Sin embargo, no hubo un beneficio significativo de la vacunación sobre la duración de la incubación, la transmisión o el intervalo de serie de las variantes omicron y delta para la infección secundaria.

La infección por Omicron puede transmitirse durante la fase asintomática temprana de la infección por SARS-CoV-2, cuando el aislamiento, el rastreo de contactos y las pruebas son imposibles porque las personas desconocen la infección. Por lo tanto, las medidas preventivas como el distanciamiento social y la restricción de las reuniones públicas son de suma importancia para frenar la rápida y generalizada propagación de Omicron.